iSpartan
iSpartan es una aplicación versátil para el modelado molecular en el iPad, iPhone y iPod Touch. La aplicación permite acceso rápido y fácil a los métodos computacionales que han demostrado ser confiable para una variedad de moléculas.
La entrada de las moléculas se realiza mediante dibujar en dos dimensiones. La aplicación convierte el dibujo en una estructura tridimensional. Conformaciones de baja energía pueden ser calculadas y analizadas. Al acceder a una base de datos de 5.000 moléculas (seleccionadas de la Spartan Spectra and Properties Database, SSPD) espectros de RMN e IR, orbitales moleculares, mapas del potencial electrostático y otras propiedades atómicas y moleculares son también disponibles. La base de datos puede ser buscada por subestructuras moleculares.
Análisis conformacional:
• Identificar la conformación más favorable
• Evaluar los confórmeros de energía alternativa
• Presentar los resultados en un diagrama de energía claro
iSpartan utiliza la probada parametrización MMFF y conduce la análisis conformacional en tiempo real.
Propiedades disponibles para todas las moléculas:
• R / S quiralidad
• Masa molar
• Áreas de superficie total y superficie polar
• Volumen molecular
• Log P
• Constantes de acoplamiento vecinales
• Distancias, ángulos y ángulos de torsión
Los espectros y otras propiedades calculadas con los métodos de la mecánica cuántica son disponibles para las 5.000 moléculas incluidas en la base de datos de iSpartan. El cálculo cuántico de otras moléculas es posible mediante la instalación del programa Spartan Parallel Suite (producto separado; disponible para Windows o Macintosh). La conexión con el programa Spartan Parallel Suite también permite el acceso a la plena base de datos SSPD (>250.000 moléculas) vía el iPad, iPhone o iPod Touch.
Espectroscopía de RMN:
• Asignar los picos observados en espectros de protón y carbono
• Confirmar o rechazar las predicciones de la estructura
• Sugerir estructuras que son más consistentes con los datos
• Descubrir y analizar estructuras alternativas
iSpartan combina los resultados de la teoría del funcional de la densidad (DFT, modelo EDF2/6-31G*) con una corrección empírica para obtener espectros de alta precisión. A diferencia de los métodos puramente empíricos, iSpartan siempre representa a la estructura en 3D (estereoquímica), así como a la conformación.
Termoquímica:
• Identificar el mejor tautómero o isómero
• Evaluar la distribución de productos en el equilibrio
• Determinar si la reacción es endotérmica o exotérmica
La teoría del funcional de la densidad es utilizada para calcular la energía total. Para la mayoría de las moléculas orgánicas la aplicación también proporciona la entalpía de formación basada en la receta termoquímica T1 de alta precisión.
Espectroscopía infrarroja:
• Asignar las bandas de absorción a los grupos funcionales
• Confirmar o rechazar las predicciones de la estructura
• Animar las vibraciones moleculares asociados con las bandas en el espectro
La calculación del espectro es basada en la teoría del funcional de la densidad. Se incluye un factor de escala para las frecuencias y una ampliación de las bandas de absorción representando a los efectos de la temperatura. El resultado es un espectro preciso y realista similar a los datos experimentales.
Orbitales moleculares y mapas del potencial electrostático:
• Analizar los orbitales moleculares frontera para anticipar la reactividad
• Utilizar mapas del potencial electrostático para evaluar la selectividad, reactividad y acidez relativa y para distinguir entre regiones polares (hidrófilos) y no polares (hidrófobos)
Otras propiedades calculadas:
• Cargas parciales de los átomos
• Momentos dipolares
Mayor productividad en la investigación química a través del modelado molecular...así es iSpartan.
La entrada de las moléculas se realiza mediante dibujar en dos dimensiones. La aplicación convierte el dibujo en una estructura tridimensional. Conformaciones de baja energía pueden ser calculadas y analizadas. Al acceder a una base de datos de 5.000 moléculas (seleccionadas de la Spartan Spectra and Properties Database, SSPD) espectros de RMN e IR, orbitales moleculares, mapas del potencial electrostático y otras propiedades atómicas y moleculares son también disponibles. La base de datos puede ser buscada por subestructuras moleculares.
Análisis conformacional:
• Identificar la conformación más favorable
• Evaluar los confórmeros de energía alternativa
• Presentar los resultados en un diagrama de energía claro
iSpartan utiliza la probada parametrización MMFF y conduce la análisis conformacional en tiempo real.
Propiedades disponibles para todas las moléculas:
• R / S quiralidad
• Masa molar
• Áreas de superficie total y superficie polar
• Volumen molecular
• Log P
• Constantes de acoplamiento vecinales
• Distancias, ángulos y ángulos de torsión
Los espectros y otras propiedades calculadas con los métodos de la mecánica cuántica son disponibles para las 5.000 moléculas incluidas en la base de datos de iSpartan. El cálculo cuántico de otras moléculas es posible mediante la instalación del programa Spartan Parallel Suite (producto separado; disponible para Windows o Macintosh). La conexión con el programa Spartan Parallel Suite también permite el acceso a la plena base de datos SSPD (>250.000 moléculas) vía el iPad, iPhone o iPod Touch.
Espectroscopía de RMN:
• Asignar los picos observados en espectros de protón y carbono
• Confirmar o rechazar las predicciones de la estructura
• Sugerir estructuras que son más consistentes con los datos
• Descubrir y analizar estructuras alternativas
iSpartan combina los resultados de la teoría del funcional de la densidad (DFT, modelo EDF2/6-31G*) con una corrección empírica para obtener espectros de alta precisión. A diferencia de los métodos puramente empíricos, iSpartan siempre representa a la estructura en 3D (estereoquímica), así como a la conformación.
Termoquímica:
• Identificar el mejor tautómero o isómero
• Evaluar la distribución de productos en el equilibrio
• Determinar si la reacción es endotérmica o exotérmica
La teoría del funcional de la densidad es utilizada para calcular la energía total. Para la mayoría de las moléculas orgánicas la aplicación también proporciona la entalpía de formación basada en la receta termoquímica T1 de alta precisión.
Espectroscopía infrarroja:
• Asignar las bandas de absorción a los grupos funcionales
• Confirmar o rechazar las predicciones de la estructura
• Animar las vibraciones moleculares asociados con las bandas en el espectro
La calculación del espectro es basada en la teoría del funcional de la densidad. Se incluye un factor de escala para las frecuencias y una ampliación de las bandas de absorción representando a los efectos de la temperatura. El resultado es un espectro preciso y realista similar a los datos experimentales.
Orbitales moleculares y mapas del potencial electrostático:
• Analizar los orbitales moleculares frontera para anticipar la reactividad
• Utilizar mapas del potencial electrostático para evaluar la selectividad, reactividad y acidez relativa y para distinguir entre regiones polares (hidrófilos) y no polares (hidrófobos)
Otras propiedades calculadas:
• Cargas parciales de los átomos
• Momentos dipolares
Mayor productividad en la investigación química a través del modelado molecular...así es iSpartan.
Categoría : Productividad
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